A educação especial concentra-se em fornecer uma educação justa e apropriada para alunos com deficiências intelectuais ou de aprendizagem, limitações físicas, deficiências visuais ou atrasos no desenvolvimento. Esses programas podem fornecer a educação profissional necessária para obter cargos em escolas específicas.

Existem várias instituições de ensino superior localizadas em todo Puerto Rico, com a Universidade de Puerto Rico sendo o maior e mais antigo. Como um território dos Estados Unidos, os cidadãos podem ter acesso a oportunidades adicionais para a educação.