O programa de doutoramento em Ginecologia e Obstetrícia inclui projectos desenvolvidos em todas as subespecialidades da disciplina, bem como projectos desenvolvidos em cooperação com outras disciplinas. O nível esperado de conhecimento profissional deve atender aos requisitos do exame de especialidade EBCOG. O Departamento de Ginecologia e Obstetrícia da Faculdade de Medicina da Charles University em Pilsen concentra suas atividades científicas e de pesquisa nos seguintes temas: Oncoginecologia, Cirurgia do assoalho pélvico, Imunologia da Reprodução, Uroginecologia, Cuidado periparto e Endoscopia Ginecológica. Há uma cooperação estreita com o Centro Biomédico da Faculdade de Medicina, um estabelecimento de pesquisa líder e de última geração. O Departamento de Ginecologia e Obstetrícia também atua como um centro regional de referência terciária e treinamento de pós-graduação. Programa de estudos sem especialização.

O Curso de Obstetrícia é um curso de três anos e visa o treinamento teórico-prático para a futura parteira. O foco está no conhecimento aprofundado da fisiologia, promoção e manutenção da saúde da mulher em todas as fases da vida, com atenção especial ao casal mãe-bebê.